Trong năm 298 từ thời của các vị thần, ba cô bé tiểu học là Sumi Washio, Sonoko Nogi và Gin Minowa sẽ trở thành những anh hùng bất đắc dĩ khi bước vào thế giới chiến tranh đầy nguy hiểm. Chọn lọc từ trong những học sinh bình thường, họ bị giao nhiệm vụ bảo vệ Shinju-sama, cây thần quan trọng duy nhất còn lại trên thế giới, đã kiên cường che chở cho Shikoku – khu vực duy nhất không bị Vertex, kẻ thù bí ẩn hung tàn, hủy diệt. Trước sức mạnh vô bờ của Vertex, ba cô bé phải đương đầu với những thử thách vượt quá sức tưởng tượng của bản thân. Rời xa cuộc sống bình thường, học tập và chơi đùa, giờ đây họ phải học cách chiến đấu, kết hợp sức mạnh di truyền của dòng họ và vũ khí thần thánh để bảo vệ thế giới từ bóng tối.

Dù tuổi còn trẻ, Sumi, Sonoko và Gin mang trong mình lòng dũng cảm và tinh thần bất khuất.

Họ sẵn sàng hi sinh mọi thứ, thậm chí cả mạng sống để bảo vệ Shikoku, biến thành những viên ngọc quý hiếm, những bảo kiếm sáng trong tim mọi người. Cuộc hành trình của ba cô bé không chỉ là trận chiến chống lạiVertex mà còn là một cuộc hành trình khám phá về bản thân, ý nghĩa của lòng trung thành và tình bạn thiêng liêng giữa những trái tim nhạy cảm.